El fin de la seguridad pública está establecida por la norma constitucional, nacional y estatal, sin embargo, para alcanzar esa meta la institución la recupera como el contenido y sustento de su existencia.

El objetivo institucional de la Secretaría de Seguridad Pública, deriva del deber que tiene impuesto por la norma y acorde al Modelo Nacional de Policía y Justicia Cívica, consiste en:

Garantizar y supervisar la operatividad de las áreas que conforman la Seguridad Pública en Baja California Sur, implementando de mecanismos de coordinación y cooperación con las instituciones que integran el Sistema Nacional de Seguridad Pública, contribuyendo a la generación y preservación del orden público y la paz social enalteciendo los derechos humanos y la equidad de género; salvaguardando la vida, la libertad, la integridad, los derechos y bienes de las personas a través de la prevención, investigación y persecución de los delitos, y la sanción de las infracciones administrativas, en los términos de la ley.